El debut del kun :Fue un 5 de julio de 2003, cuando el por entonces técnico Oscar Ruggeri lo hizo ingresar en el segundo tiempo del partido frente a San Lorenzo. Ya desde el arranque hizo historia: Es el jugador más joven en debutar en Primera, con 15 años, 1 mes y tres días.En ese partido, que terminó 1 a 0 a favor de San Lorenzo, Kun ingresó a los 23 minutos del segundo tiempo con la camiseta 34. Curiosamente, el día que él se presentaba ante los hinchas de Independiente, un gran ídolo dejaba el club para seguir su carrera en Europa: Gabriel Milito. Ese desfachatado juvenil que vino desde la Octava no tuvo mucha incidencia en el juego, aunque se las ingenió para mostrar un par de destellos de su talento.  Y el Kun no defraudó: marcó su primer gol en Primera frente a Estudiantes.
El boom llegaria a partir del 2005 con los goles, el glorioso 4 a 0 en el clásico de Avellaneda ante Racing. Además, se consagró campeón mundial juvenil en la Copa del Mundo Sub 20 de Holanda. 
En el 05/06 estuvo en 36 partidios de los 38 partidos jugados y los dos q se perdió fue por suspencion.Marcó 18 goles en este lapso, siendo el goleador de su equipo.Su dolorosa despedida fue ante Rosario Central entre lágrimas y la esperanza de que volverá un día a vestirse la camiseta de Independiente.
El kun se depidio del club con 26 goles de 56 partidos juagados.Alla lo esperaba el atletico madrid; quien págó un cifra record para el futbol argentino.En la temporada 06/07 marcó su debut en Europa.en la que marcó siete goles,  Además, volvió a hacer historia al convertirse en uno de los privilegiados en ganar dos veces el Mundial Sub 20, ya que fue figura y goleador del torneo disputado en Canadá. 
Aguero o kun  no sólo es un nombre reconocido en España, sino que también es un número puesto para la Selección Argentina, estando siempre entre los convocados por el entrenador Alfio Basile. Hasta el momento Kun disputó 11 partidos con la celeste y blanca y marcó tres goles. 
Se cumplieron ya cinco años del nacimiento de una leyenda, que enamoró a los hinchas de Independiente a pura gambeta y talento, que se abrió el camino hacia Europa y que en numerables ocasiones comentó que su idea es cerrar su carrera en el club que lo vio nacer. Este es Sergio Agüero, pura magia made in Independiente